Watchmaker Genomics, leader des solutions de workflow NGS haute performance, a annoncé aujourd’hui qu’elle présenterait deux nouvelles technologies lors du congrès 2026 de la Société européenne de génétique humaine (ESHG). Celles-ci sont conçues pour répondre aux goulots d’étranglement persistants liés à l’évolutivité des workflows de séquençage et à la précision de l’amplification.
Ces nouveautés comprennent le kit de normalisation EquiPlex™, qui simplifie la normalisation des bibliothèques grâce à une nouvelle approche fondée sur Cas9, ainsi que le mélange maître d’amplification de bibliothèques Equinox® Prime, conçu pour améliorer la précision de la détection des indels dans les régions génomiques répétitives, tout en offrant des performances d’amplification supérieures pour l’ensemble des applications de séquençage.
S’appuyant sur l’expertise de Watchmaker en ingénierie des protéines et en conception de workflows intégrés, ces technologies témoignent de l’engagement constant de l’entreprise à résoudre les défis concrets du séquençage qui influent sur l’efficacité opérationnelle, l’évolutivité et la qualité des données en aval.
« Les workflows de séquençage continuent de gagner en ampleur et en complexité, mais nombre des principaux goulots d’étranglement auxquels les chercheurs sont confrontés aujourd’hui demeurent fondamentalement inchangés », a déclaré Trey Foskett, PDG de Watchmaker. « Ces lancements témoignent de notre volonté de concevoir des technologies qui non seulement améliorent la qualité des données, mais simplifient également les workflows et permettent aux chercheurs de travailler plus efficacement à grande échelle », a-t-il ajouté.
Le kit de normalisation EquiPlex™ simplifie le regroupement de bibliothèques à grande échelle
EquiPlex propose une approche innovante de la normalisation des bibliothèques, en réorientant la technologie CRISPR-Cas9 pour en faire un outil de liaison moléculaire stœchiométrique plutôt qu’une enzyme de coupure. Cette technologie capture un nombre fixe de molécules dans chaque bibliothèque, quelle que soit la concentration initiale, ce qui permet une normalisation rapide et automatisée pour un large éventail d’applications et de types d’échantillons.
Ce workflow supprime le besoin de contrôler la concentration des bibliothèques, d’effectuer des calculs de dilution et de réaliser des étapes de pipetage à volume variable, difficiles à automatiser, sources d’erreurs et qui contribuent fréquemment à la variabilité des pools et aux déséquilibres de séquençage. Compatible avec les workflows existants de séquençage de l’ARN, de l’ADN et de la méthylation, EquiPlex est conçu pour rationaliser les opérations de séquençage et améliorer la cohérence des pools, sans obliger les chercheurs à repenser leurs processus établis de préparation des bibliothèques.
« La normalisation des bibliothèques avant leur regroupement a toujours été une contrainte, en particulier à grande échelle », a déclaré Graham Wiley, PhD, directeur du Centre de génomique clinique de l’Oklahoma Medical Research Foundation. « Nos précédents pipelines conservaient souvent un certain degré de variabilité, qui nous obligeait à réaliser des séquençages supplémentaires pour atteindre nos objectifs de couverture. Avec EquiPlex, nous avons enfin obtenu le niveau de cohérence de regroupement que nous recherchions », a-t-il ajouté.
Watchmaker continue d’adapter cette stratégie de normalisation fondée sur la technologie CRISPR afin d’en faire un composant central d’une nouvelle solution de séquençage du génome entier sans PCR, conçue pour rationaliser les étapes de fragmentation, de normalisation et de construction de bibliothèques pour les laboratoires ayant besoin de données WGS fiables, reproductibles et de haute qualité à grande échelle.
Equinox Prime améliore la précision de l’amplification dans les régions génomiques complexes
Watchmaker lancera également Equinox Prime Library Amplification Master Mix, une solution d’amplification de nouvelle génération conçue pour réduire le glissement de la polymérase dans les régions homopolymères et les régions génomiques répétitives sujettes aux artefacts d’indels.
Cette technologie a été conçue pour améliorer la précision de l’identification des variants dans les applications où la précision des indels est essentielle, notamment dans les workflows d’oncologie somatique, tels que le profilage de l’instabilité des microsatellites (MSI), tout en offrant des gains de performance étendus pour le séquençage du génome entier (WGS), le séquençage de l’exome entier (WES) et d’autres applications de séquençage.
Au-delà d’une précision accrue dans la détection des indels, Equinox Prime offre de faibles taux d’erreur, des rendements élevés en bibliothèques et une couverture GC homogène, afin de prendre en charge les workflows de séquençage exigeants dans lesquels les performances d’amplification ont une incidence directe sur la qualité du séquençage en aval.
« Les chercheurs ont historiquement dû faire des compromis en matière de performances d’amplification des bibliothèques, en arbitrant entre rendement et uniformité de la couverture, d’une part, et précision du séquençage, d’autre part, selon l’application », a déclaré Brian Kudlow, directeur scientifique de Watchmaker. « Equinox Prime a été conçu pour éliminer ces compromis en offrant une précision accrue pour les indels dans les régions répétitives, ainsi que de faibles taux d’erreur, des rendements élevés et une couverture GC homogène, le tout au sein d’une solution unique », a-t-il ajouté.
En avant-première à l'ESHG 2026
Watchmaker présentera ces avancées lors du congrès ESHG à Göteborg, en Suède, dans le cadre de son atelier intitulé From Multiomics to Multiplexing: Integrated Advances in DNA, RNA, and Epigenomic Profiling (« De la multiomique au multiplexage : avancées intégrées dans le profilage de l’ADN, de l’ARN et de l’épigénome »), le lundi 15 juin.
Cet atelier mettra en avant de nouvelles approches visant à améliorer la qualité du séquençage, à simplifier les workflows et à rendre la génomique évolutive dans les applications liées à l’ADN, à l’ARN et à l’épigénomique, avec notamment le lancement d’EquiPlex et d’Equinox Prime.
À propos de Watchmaker Genomics
Watchmaker Genomics est une entreprise des sciences de la vie spécialisée dans le développement d'outils performants destinés à la recherche génomique et aux applications cliniques. Forte de son expertise en ingénierie des protéines et en séquençage de nouvelle génération, Watchmaker fournit des réactifs et des plateformes de précision garantissant une exactitude, une efficacité et une rentabilité optimales en analyse moléculaire. L'entreprise s'engage à développer des technologies de pointe pour soutenir les innovations dans le dépistage du cancer, l'épigénétique et les applications de biopsie liquide.
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