L’AFP est administrée par un conseil d’administration présidé par le président-directeur général. Il comprend en plus du président, cinq représentants, des directeurs d’entreprises françaises de publication de journaux quotidiens désignés par les organisations professionnelles les plus représentatives. Deux représentants des sociétés nationales de programmes, trois représentants des services publics usagers de l’Agence, trois représentants du personnel de l’AFP et cinq personnalités nommées par le conseil supérieur de l’Agence en raison de leur connaissance des médias et des technologies numériques et de leurs compétences économiques et de gestion, trois d’entre elles au moins possédant une expérience significative au niveau européen  ou international.
 

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Les membres du conseil supérieur sont désignés pour cinq ans. Leur mandat est renouvelable une fois. Il est incompatible avec celui de membre du conseil d'administration ou de membre de la commission financière (JOF du 8 novembre 2015).
Le conseil supérieur peut être saisi par un usager ou une organisation professionnelle de presse, ou, dans les conditions prévues à l’article 12, par la commission financière, de tout fait de nature à constituer une infraction aux obligations énoncées à l’article 2 (Article 5, Loi n° 57-32 du 10 janvier 1957 portant statut de l’Agence France-Presse. Version à jour au 17 avril 2015).

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La commission financière comprend trois membres de la Cour des comptes en activité désignés par le premier président, dont l’un préside la commission. Les membres de la commission financière sont désignés  pour une durée de cinq ans renouvelable.

La commission financière est saisie de l’état annuel de prévision des recettes et des dépenses de l’Agence.
 

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